@ 2022.04.11 , 15:42

新研究在海洋中发现5500种新病毒

根据一项新研究,在全球海洋中已经发现了超过5000种新病毒。

该研究的研究人员分析了采自全球的数万份水源样本,寻找其中的RNA病毒,也就是使用RNA作为其遗传物质的病毒。比如说新冠病毒就是一种RNA病毒。作者表示,相较于DNA病毒,我们对RNA病毒的研究不足。

新发现病毒的多样性太丰富了,以至于为了给RNA病毒进行分类,研究人员提议需要将分类群的数量从现存的5个门翻倍到10个门。

“有太多新的多样性——还在所有的海洋中发现了一个完整的新门Taraviricota,这表明它们在生态学上非常重要,”俄亥俄州立大学的微生物学教授、该研究的第一作者Matthew Sullivan在一项声明中指出。

Sullivan说,针对RNA病毒的研究通常重点都是那些会引发疾病的病毒(一些知名的RNA病毒有流感、埃博拉和新冠病毒)。但这些它们只是地球上RNA病毒的冰山一角。

Sullivan在声明中表示:“我们想要系统性大规模的研究它们,并且在一个此前没有被人深入关注过的环境中探索它们。”

该研究发表在了4月7日刊的《科学》杂志上,研究人员分析了采自五大洋121个位置的35000份水源样本。这些研究人员隶属于塔拉海洋基金会下一个研究气候变化对海洋影响的全球项目。

研究人员表示,他们检验了从浮游生物身上提取的基因序列,因为它们是RNA常见的宿主。他们对准属于RNA病毒的序列,寻找一种名为RdRp的古老基因,所有的RNA病毒都有这种基因,但其它的病毒和细胞却没有。他们发现了4.4万个包含该基因的序列。

但是RdRp基因有着数十亿岁,也进化过很多次。由于这种基因的进化之路十分久远,所以研究人员很难判断序列之间的进化关系。因此研究人员使用机器学习来协助整理。

他们总共发现了5500种归属于现存5门的新RNA病毒,还发现了5个新提出的门,他们分别命名为Taraviricota, Pomiviricota, Paraxenoviricota, Wamoviricota以及Arctiviricota。

研究人员写道,Taraviricota门的病毒在温带和热带水域尤为丰富,而Arctiviricota门则在北冰洋特别丰富。

作者表示,弄清RdRp基因是如何随时间而分化能够更好的理解地球上的早期生命是如何进化的。

“RdRp应该是最古老的基因之一——在需要DNA之前它就存在了,”研究的共著者、俄亥俄州立大学的研究科学家Ahmed Zayed说,“所以我们追溯的不仅是病毒的起源,还有生命的起源。”

本文译自 LiveScience,由 Diehard 编辑发布。

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