新冠
新冠病毒可能无法完全清除，从而导致长期新冠
尽管大多数人能够从新冠中幸存并恢复，但对于一些人来说，症状可能会持续数月甚至数年。当症状持续时间超过12周时，这种情况被称为长期新冠。
长期新冠包括多达200种不同的症状。为了确定这些症状的循证治疗方法，我们需要了解其原因。可能与长期新冠有关的一个因素是，病毒在最初感染后并未完全清除体外。
我们知道，从其他病毒中可以发现病毒碎片可以在不同的组织中存留数月甚至数年。这也可能是导致引发新冠的病毒新冠病毒的情况。以下是目前的科学认识。
其他病毒在体内潜伏
疱疹病毒(例如腺病毒引起的埃普斯坦-巴尔病毒)以及人类免疫缺陷病毒(HIV)可以在“潜伏状态”下存在终身。这意味着病毒隐藏在细胞内并处于休眠状态。
特别是HIV可以在整个身体的感染细胞中保持休眠状态。即使它处于不活动状态，它仍然可以促进免疫激活和炎症。
发现其他病毒，例如寨卡病毒、麻疹和埃博拉病毒在感染者的组织中数月或数年后。这种病毒持续存在可能会导致慢性疾病。
多项研究表明，新冠也可能会重新激活处于潜伏状态的埃普斯坦-巴尔病毒。研究表明，这与长期新冠患者的疲劳、思考和推理问题有关。
我们如何知道新冠病毒仍在体内
多项研究已经确定了新冠病毒(RNA)的遗传序列以及在感染后数月的组织和粪便样本中的新冠病毒蛋白质。
这些研究包括多份尸检报告，发现在感染后长达七个月的人的多种组织中发现病毒RNA和蛋白质。在经过测试的心脏、淋巴腺、眼睛、神经、大脑和肺组织样本中，至少有一半样本检测到新冠病毒 RNA。
在幸存者中，在进行结肠镜检查时，在感染四个月后，肠道组织中发现了病毒RNA。这些患者患有无症状的新冠，并且在四个月时从鼻子和喉咙的拭子检测为PCR阴性。
2022年的一项研究发现，约一半的参与者在感染后的第一周中在大便中发现了新冠病毒。四个月后，呼吸道中不再存在病毒，但12.7％的大便样本仍然是RNA阳性。另外，3.8％的粪便样本在七个月后仍然是RNA阳性。
最初的研究并没有总是表明长期检测到新冠病毒与长期新冠症状之间存在强烈的关系。
但是，最近发现在血液和肠道组织中发现新冠病毒 RNA(或由RNA翻译的蛋白质)会增加患有长期新冠症状的可能性。
病毒滞留可能会对长期新冠患者产生什么影响
在身体的不同部位中延迟清除新冠病毒粒子可能会通过几个潜在的过程推动疾病：
1)炎症。病毒蛋白的持续免疫刺激会引起炎症，使我们的免疫系统疲劳，并随着时间的推移改变我们的免疫细胞工作。
我们之前已经显示，免疫功能障碍和炎症在最初患有轻度至中度新冠的长期新冠患者中持续了八个月。
2)其他潜伏病毒的激活。持续对新冠病毒的免疫反应可能会导致潜伏病毒的重新激活。
长期新冠患者的埃普斯坦-巴尔病毒反应性抗体升高表明了埃普斯坦-巴尔病毒的重新激活，可能是通过激活免疫系统实现的。
最近的研究还表明，在感染后，其他潜伏病毒，如人类内源性逆转录病毒(HERV；成为我们DNA的一部分的古老病毒，就像遗传化石一样)也被发现在新冠患者的血液细胞和组织中被重新激活。这些蛋白质可能会在长期新冠中推动炎症过程。
3)通过与新冠病毒抗击而产生的抗体可能会变得“自我”反应。这些自身抗体(由我们的免疫系统误认并攻击我们自己的身体组织或器官产生的抗体)可能会与宿主受体或蛋白质发生交叉反应，并推动自身免疫性疾病。
重要的是，最近的研究表明，新发生的自身免疫疾病(例如1型糖尿病、炎症性肠病和牛皮癣)与新冠病毒感染有显著关联，而自身免疫性疾病和长期新冠之间的联系是可信的。