狗狗
澳大利亚野狗原来是介于灰狼和家犬之间的物种
很多人都知道现代狗是从灰狼进化而来的。但是您知道今天 340 多种现代犬种中的大多数是在过去 200 年内才出现的吗？
狗在 29000 至 14000 年前的新石器时代首次被驯化，从那时起就与人类密切相关。
野狗——澳大利亚唯一的本土犬——被认为代表了犬科进化中的一个独特事件，它于 5000 至 8000 年前抵达澳大利亚。
然而，野狗在狗的进化家谱中的确切位置一直未知。
为了找出它们在进化过程中与灰狼的分歧，我们使用尖端的 DNA 测序技术发现野狗与家犬有根本的不同。
在周五发表在《科学进展》上的研究中，我们与来自四个国家的 25 名研究人员合作，表明野狗是现代狗的早期分支，位于灰狼和今天的驯养狗之间。
通过研究狗，我们可以深入了解我们作为人类如何影响它们的身体和行为特征，以及观察它们基因组的变化。
例如，狗直到最近才发展出抬起眉毛的能力——这种特征很可能是为了更有效地与人类交流而发展起来的。所以看起来小狗的眼睛真的是为我们“创造”的。
但有些例子并不那么明显，只能通过深入研究狗的基因组才能找到。
例如，之前的科学研究表明，狗需要一种特定的基因(淀粉酶 2B)来消化淀粉。许多犬种携带该基因的多个副本(有时超过十个副本)。然而，狼和野狗只保留了这个基因的一个拷贝。
现代狗出现多组拷贝基因可能是由于最早驯养时的饮食发生了变化，因为它们越来越多地被喂食淀粉类食物，例如大米(通过早期广泛的农业种植)。
有趣的是，同样的基因复制在其他最近被驯化的家畜中独立发生，这表明人工力量确实影响了驯化动物的基因组。
现代狗的早期分支
野狗是独一无二的，因为它们在地理上与狼和家犬隔绝了数千年。在我们的研究中，我们使用遗传学来帮助我们准确了解野狗在狗的进化中所处的位置，以及它在澳大利亚生态系统中的作用。
最初，在 2017 年，我们只能获得一个狗基因组作为比较点(拳击犬)。由于当时的技术限制，它包含许多空白。
然而，同年，野狗赢得了美国生物技术公司 Pacific Biosciences 举办的“世界上最有趣的基因组”比赛。这让我们开始考虑生成高质量的野狗基因组。
但要了解野狗在狗的历史中的地位，我们还需要几个高质量的狗基因组。所以我们生成了一个德国牧羊犬基因组作为代表品种，其次是basenji(刚果最早用于狩猎的犬种)。
最后，我们能够对一只被遗弃在内陆的纯沙漠小野狗桑迪进行基因组测序。
由于长读长测序技术的发展，产生高质量基因组的能力在最近几年才成为可能。这项技术对于最近完成的人类基因组项目也至关重要。
利用新的狗基因组——以及格陵兰狼和其他代表性物种(包括大丹犬、拳击犬和拉布拉多犬)的现有基因组——我们测量了这些品种和野狗之间的遗传差异数量，以明确显示野狗在进化时间表。
我们发现，介于狼和今天的驯养犬之间。
总的来说，我们的分析显示了不同的人口和环境条件如何塑造了野狗基因组。
我们不能确定野狗是否曾经被驯化，但我们知道它在抵达澳大利亚后不太可能被驯化。
未来对更多野狗基因组的研究将解决野狗是否曾经被驯化，并衡量纯野狗与家犬杂交的水平和影响。
虽然许多杂种野狗在外观上相似，但存在大量杂交，特别是在新南威尔士州和维多利亚州。
这个知识很重要。更好地了解野狗与狗杂交的影响，可以深入了解野狗在生态系统中的作用，从而有助于未来的保护工作。
https://www.sciencealert.com/we-finally-know-where-dingos-sit-in-dogs-evolutionary-family-tree