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majer @ 2019.10.15 , 11:00
Python脚本bug或致上百篇论文出错
根据上周二出版的Organic Letters期刊，夏威夷大学的研究人员发现，在许多研究项目中调用的Python工具，存在代码bug——超100篇已发表论文可能会因此得出错误结论。
在该脚本的公开和调试版本中，总计约有1000行代码。Bug会导致化学模拟的结果因操作系统而异——研究人员使用Mac，Windows和Linux系统会得到不同的结果。
“原始脚本中出现的这种简单bug使人们开始质疑覆盖了大量主题的研究论文的结论；由于相关论文很少提及具体的操作系统，因此无法轻易从已发布的信息中甄别出问题结论。所以，使用过脚本的作者应该使用修正脚本重新审查其结果和相关结论。”
夏威夷大学马诺阿分校的研究生Yuheng Luo今年夏天打算验证化学教授Philip Williams某项有关蓝细菌的研究结论。
在助理化学教授Rui Sun的帮助下，Luo调用了由Python编写的脚本分析工具——2014年，由Patrick Willoughby，Matthew Jansma和Thomas Hoye发布在Nature Protocols杂志上。
脚本可以用来计算NMR或核磁共振波谱的化学位移值，这是化学家用来确定样品分子组成的常用技术。 Luo的结果与Williams团队先前算得的NMR值不符——最终，他们意识到不同的操作系统会产生不同的结果。Bug与不同操作系统对文件的排序方式有关。
代码的原作者公开声称，新揪出的bug“是体现科学工作范式一个绝佳的例子，完善了我们在2014年的工作。他们为技术社区做出了巨大贡献。”
Sun表示，代码的原作者“非常客气”，称他们鼓励他发表自己的发现。